MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 20847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009633	ATA	3	9	1166635	1166643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_009633	GGA	2	6	1166688	1166693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_009633	G	6	6	1167483	1167488	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_009633	TTA	2	6	1167489	1167494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_009633	A	7	7	1168001	1168007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_009633	AATCA	2	10	1168067	1168076	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5007	NC_009633	GTAT	2	8	1168107	1168114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_009633	AAC	2	6	1168257	1168262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_009633	GAG	2	6	1168285	1168290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_009633	CTA	2	6	1168321	1168326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_009633	TAA	2	6	1168331	1168336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_009633	T	7	7	1168359	1168365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_009633	ATA	2	6	1168385	1168390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_009633	T	6	6	1168415	1168420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_009633	TA	3	6	1168468	1168473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_009633	AT	3	6	1168483	1168488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_009633	TTG	2	6	1168530	1168535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_009633	TAT	2	6	1168558	1168563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_009633	TA	3	6	1168654	1168659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_009633	ATG	2	6	1175296	1175301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_009633	ATA	2	6	1175331	1175336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_009633	TTC	2	6	1176317	1176322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_009633	AAAT	2	8	1176370	1176377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_009633	T	6	6	1176416	1176421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_009633	GA	4	8	1176429	1176436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5032	NC_009633	TA	3	6	1176537	1176542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_009633	ATG	3	9	1176964	1176972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_009633	ATTA	2	8	1176975	1176982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_009633	GAG	2	6	1176990	1176995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_009633	TAA	2	6	1177349	1177354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_009633	ATA	2	6	1177367	1177372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5039	NC_009633	T	6	6	1177417	1177422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_009633	T	6	6	1177433	1177438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_009633	ATA	2	6	1178143	1178148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_009633	A	6	6	1178148	1178153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_009633	A	6	6	1178164	1178169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_009633	CTT	2	6	1178185	1178190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_009633	TATAG	2	10	1178219	1178228	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5049	NC_009633	TAAA	2	8	1184992	1184999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5052	NC_009633	A	9	9	1185090	1185098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_009633	TA	3	6	1185132	1185137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5059	NC_009633	AGG	2	6	1186944	1186949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5061	NC_009633	AGG	2	6	1191682	1191687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_009633	ATT	2	6	1194095	1194100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_009633	T	6	6	1194099	1194104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_009633	TTTA	2	8	1194126	1194133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_009633	TGAAC	2	10	1196451	1196460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5070	NC_009633	A	6	6	1196528	1196533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_009633	AGTTA	2	10	1204068	1204077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5103	NC_009633	TA	4	8	1204130	1204137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_009633	GTT	2	6	1204138	1204143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_009633	TCATA	2	10	1204200	1204209	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5106	NC_009633	GGA	2	6	1204236	1204241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5111	NC_009633	ATT	2	6	1205747	1205752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_009633	T	6	6	1205757	1205762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_009633	A	6	6	1205792	1205797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_009633	ACAG	2	8	1205819	1205826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_009633	AGG	2	6	1205859	1205864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_009633	AAATCA	2	12	1209844	1209855	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5120	NC_009633	A	6	6	1211841	1211846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5122	NC_009633	AAGA	2	8	1211918	1211925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_009633	TGG	2	6	1211926	1211931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_009633	TGG	2	6	1212084	1212089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5129	NC_009633	GA	3	6	1212136	1212141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_009633	A	7	7	1212211	1212217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_009633	T	7	7	1212234	1212240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_009633	TCC	2	6	1214742	1214747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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